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🛠️ Repro Enforcer

repro-enforcer

バイオインフォマティクス解析を、Conda環境やNextflowパイプラインを含む再現可能なバンドルとしてエクスポートするSkill。

⏱ コードレビュー 1時間 → 10分

📺 まず動画で見る(YouTube)

▶ 【衝撃】最強のAIエージェント「Claude Code」の最新機能・使い方・プログラミングをAIで効率化する超実践術を解説! ↗

※ jpskill.com 編集部が参考用に選んだ動画です。動画の内容と Skill の挙動は厳密には一致しないことがあります。

📜 元の英語説明(参考)

Export any bioinformatics analysis as a reproducible bundle with Conda environment, Singularity container definition, and Nextflow pipeline.

🇯🇵 日本人クリエイター向け解説

一言でいうと

バイオインフォマティクス解析を、Conda環境やNextflowパイプラインを含む再現可能なバンドルとしてエクスポートするSkill。

※ jpskill.com 編集部が日本のビジネス現場向けに補足した解説です。Skill本体の挙動とは独立した参考情報です。

⚠️ ダウンロード・利用は自己責任でお願いします。当サイトは内容・動作・安全性について責任を負いません。

🎯 このSkillでできること

下記の説明文を読むと、このSkillがあなたに何をしてくれるかが分かります。Claudeにこの分野の依頼をすると、自動で発動します。

📦 インストール方法 (3ステップ)

  1. 1. 上の「ダウンロード」ボタンを押して .skill ファイルを取得
  2. 2. ファイル名の拡張子を .skill から .zip に変えて展開(macは自動展開可)
  3. 3. 展開してできたフォルダを、ホームフォルダの .claude/skills/ に置く
    • · macOS / Linux: ~/.claude/skills/
    • · Windows: %USERPROFILE%\.claude\skills\

Claude Code を再起動すれば完了。「このSkillを使って…」と話しかけなくても、関連する依頼で自動的に呼び出されます。

詳しい使い方ガイドを見る →
最終更新
2026-05-17
取得日時
2026-05-17
同梱ファイル
1

💬 こう話しかけるだけ — サンプルプロンプト

  • Repro Enforcer を使って、最小構成のサンプルコードを示して
  • Repro Enforcer の主な使い方と注意点を教えて
  • Repro Enforcer を既存プロジェクトに組み込む方法を教えて

これをClaude Code に貼るだけで、このSkillが自動発動します。

📖 Claude が読む原文 SKILL.md(中身を展開)

この本文は AI(Claude)が読むための原文(英語または中国語)です。日本語訳は順次追加中。

🦖 Repro Enforcer

You are the Repro Enforcer, a specialised agent for making bioinformatics analyses reproducible and portable.

Core Capabilities

  1. Conda Export: Capture the current environment as a pinned environment.yml
  2. Singularity Definition: Generate a Singularity .def file from the analysis dependencies
  3. Docker Compose: Generate Dockerfile and docker-compose.yml for containerised execution
  4. Nextflow Pipeline: Convert a sequence of shell commands into a Nextflow DSL2 pipeline
  5. Snakemake Workflow: Alternative workflow export as Snakefile
  6. Checksum Manifest: SHA-256 hashes for all input/output files
  7. README Generation: Human-readable reproduction instructions

Dependencies

  • pyyaml (YAML generation)
  • Optional: conda (environment capture), singularity (container build), nextflow (pipeline validation)

Example Queries

  • "Make this analysis reproducible as a Nextflow pipeline"
  • "Export my current conda environment with pinned versions"
  • "Generate a Singularity container for this workflow"
  • "Create a checksums file for all input and output data"

Status

Planned -- implementation targeting Week 6 (Apr 3-9).