📦 Omics Target Evidence Mapper
創薬研究などで注目する標的（ターゲット）に関する
📺 まず動画で見る(YouTube)
▶ 【Claude Code完全入門】誰でも使える/Skills活用法/経営者こそ使うべき ↗
※ jpskill.com 編集部が参考用に選んだ動画です。動画の内容と Skill の挙動は厳密には一致しないことがあります。
📜 元の英語説明(参考)
Aggregate public target-level evidence across omics and translational sources for research triage.
🇯🇵 日本人クリエイター向け解説
創薬研究などで注目する標的（ターゲット）に関する
※ jpskill.com 編集部が日本のビジネス現場向けに補足した解説です。Skill本体の挙動とは独立した参考情報です。
⚠️ ダウンロード・利用は自己責任でお願いします。当サイトは内容・動作・安全性について責任を負いません。
🎯 このSkillでできること
下記の説明文を読むと、このSkillがあなたに何をしてくれるかが分かります。Claudeにこの分野の依頼をすると、自動で発動します。
📦 インストール方法 (3ステップ)
- 1. 上の「ダウンロード」ボタンを押して .skill ファイルを取得
- 2. ファイル名の拡張子を .skill から .zip に変えて展開(macは自動展開可)
- 3. 展開してできたフォルダを、ホームフォルダの
.claude/skills/に置く- · macOS / Linux:
~/.claude/skills/ - · Windows:
%USERPROFILE%\.claude\skills\
- · macOS / Linux:
Claude Code を再起動すれば完了。「このSkillを使って…」と話しかけなくても、関連する依頼で自動的に呼び出されます。
詳しい使い方ガイドを見る →- 最終更新
- 2026-05-17
- 取得日時
- 2026-05-17
- 同梱ファイル
- 1
💬 こう話しかけるだけ — サンプルプロンプト
- › Omics Target Evidence Mapper の使い方を教えて
- › Omics Target Evidence Mapper で何ができるか具体例で見せて
- › Omics Target Evidence Mapper を初めて使う人向けにステップを案内して
これをClaude Code に貼るだけで、このSkillが自動発動します。
📖 Claude が読む原文 SKILL.md(中身を展開)
この本文は AI(Claude)が読むための原文(英語または中国語)です。日本語訳は順次追加中。
Why This Exists
Researchers often need a quick first-pass view of whether a gene or protein target has evidence across multiple public sources. In practice, this usually means checking several websites manually and informally combining results. This skill makes that process reproducible by retrieving and organising public evidence into one structured output.
This skill is for research triage only. It does not infer causality, rank therapeutic value, or make clinical recommendations.
Core Capabilities
- Accept a gene or protein target and an optional disease term.
- Retrieve canonical target information from UniProt.
- Retrieve disease-target association evidence from Open Targets.
- Retrieve recent literature hits from PubMed.
- Optionally retrieve trial records relevant to the target and disease.
- Produce a machine-readable JSON file and a human-readable Markdown report.
Input Formats
| Argument | Required | Example | Notes |
|---|---|---|---|
--gene |
Yes, unless --demo is used |
IL6R |
Gene or target symbol |
--disease |
No | coronary artery disease |
Optional disease context |
--output |
Yes | demo_out |
Output directory |
--max-papers |
No | 5 |
Number of PubMed hits to include |
--max-trials |
No | 5 |
Number of trial records to include |
--demo |
No | --demo |
Runs the built-in demo query |
Workflow
- Validate CLI inputs.
- Resolve the query from either user input or demo mode.
- Query public data sources.
- Normalise results into a structured evidence object.
- Write JSON and Markdown outputs.
- Write reproducibility bundle:
reproducibility/checksums.sha256— SHA-256 hashes of all output filesreproducibility/environment.yml— pinned Conda/pip environmentro-crate-metadata.json— RO-Crate 1.1 provenance record (run params, outputs, script)
CLI Reference
Demo mode
python skills/omics-target-evidence-mapper/omics_target_evidence_mapper.py --demo --output demo_out